تشخیص سنگ کلیه عمدتاً بوسیله ی بررسی عکس ساده شکم یا سونوگرافی، علایم بالینی، آزمایش ادرار، است. یکی از دقیق ترین روش های تشخیصی سنگ های سیستم ادراری استفاده از روش های تصویر برداری می باشد که در مورد سنگ کلیه می توان از سونوگرافی و سی تی اسکن بهره جست. همچنین برای تشخیص جنس سنگ کلیه و انتخاب روش درمانی مناسب از بیمار خواسته می شود که سنگ های دفع کرده خود را برای بررسی به آزمایشگاه ببرد.

اگر سنگ کلیه آن قدر بزرگ باشد که به طور طبیعی دفع نشود، باید برای درمان درد کلیه و خارج کردن آن از بدن درمان لازم انجام شود. درمان سنگ کلیه شامل تجویز داروهایی برای ، شل کردن عضلات حالب(برای حرکت سریعتر سنگ)، کاهش درد، داروهایی برای حل کردن سنگ، سنگ شکن و نهایتاً جراحی است.

• سنگ شکنی برون اندامی با شاک ویو ( ESWL ): روشی غیر تهاجمی و بهترین انتخاب برای سنگ های کلیوی با قطر4mm تا 2cm که به صورت سرپایی انجام می شود و حدود یک ساعت به طول می انجامد. در این روش ابتدا محل دقیق سنگ کلیه با امواج صوتی با فرکانس بالا تعیین و سپس امواج شوکی فراصوت از دستگاه به سنگ فرستاده می‌شود تا سنگ خرد شود و بیمار بتواند سنگهای خرد شده را از راه ادرار دفع کند.
• نفرولیتومی از طریق پوست ( PCNL ): نفرولیتومی عمل جایگزینی است که برای درمان سنگهای بزرگتر یا در صورت مناسب نبودن شاک ویو انجام میشود. متخصص اورولوژی، تلسکوپ باریکی را از راه برش کوچک ایجاد شده در پشت بدن وارد کلیه میکند و سنگ را بیرون می آورد یا آن را با لیزر یا انرژی هوا می;شکند تا بیمار سنگ ریزه‌ها را راحت‌تر دفع کند.
• عمل جراحی باز: امروزه این روش به ندرت استفاده می شود و معمولاً زمانی کاربرد دارد که سنگ بسیار بزرگ یا شکل غیرطبیعی داشته باشد.